Česká geologická služba (ČGS) se mimo jiné zaměřuje na výzkum podzemních vod a na poznání zákonitostí proudění podzemních vod v hydrogeologických strukturách. Studium zahrnuje také stanovení hydraulických vlastností hornin a chemického složení podzemních vod včetně stanovení doby zdržení podzemní vody v horninovém prostředí. Výsledkem výzkumů je především definování podmínek tvorby zásob podzemních vod a stanovení vhodných podmínek jejich využívání a ochrany.
Hlavní směry výzkumu ČGS v současné době jsou: